Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rab42Q0PD08 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rab42Q0PD08 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rab42Q0PD08 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rab42Q0PD08 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rab42Q0PD08 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rab42Q0PD08 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rab42Q0PD08 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rab42Q0PD08 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rab42Q0PD08 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rab42Q0PD08 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rab42Q0PD08 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rab42Q0PD08 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rab42Q0PD08 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rab42Q0PD08 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rab42Q0PD08 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab42Q0PD08 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab42Q0PD08 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab42Q0PD08 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab42Q0PD08 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab42Q0PD08 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab42Q0PD08 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rab42Q0PD08 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab42Q0PD08 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab42Q0PD08 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab42Q0PD08 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab42Q0PD08 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab42Q0PD08 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab42Q0PD08 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab42Q0PD08 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab42Q0PD08 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab42Q0PD08 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab42Q0PD08 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab42Q0PD08 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab42Q0PD08 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab42Q0PD08 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab42Q0PD08 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab42Q0PD08 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab42Q0PD08 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab42Q0PD08 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab42Q0PD08 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab42Q0PD08 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab42Q0PD08 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab42Q0PD08 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab42Q0PD08 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab42Q0PD08 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab42Q0PD08 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab42Q0PD08 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rab42Q0PD08 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab42Q0PD08 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab42Q0PD08 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab42Q0PD08 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab42Q0PD08 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab42Q0PD08 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab42Q0PD08 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab42Q0PD08 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab42Q0PD08 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab42Q0PD08 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab42Q0PD08 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab42Q0PD08 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab42Q0PD08 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab42Q0PD08 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab42Q0PD08 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab42Q0PD08 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab42Q0PD08 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab42Q0PD08 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab42Q0PD08 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab42Q0PD08 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab42Q0PD08 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab42Q0PD08 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab42Q0PD08 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab42Q0PD08 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab42Q0PD08 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab42Q0PD08 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab42Q0PD08 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab42Q0PD08 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rab42Q0PD08 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab42Q0PD08 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab42Q0PD08 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab42Q0PD08 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab42Q0PD08 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab42Q0PD08 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab42Q0PD08 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab42Q0PD08 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab42Q0PD08 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab42Q0PD08 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab42Q0PD08 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab42Q0PD08 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab42Q0PD08 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab42Q0PD08 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab42Q0PD08 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab42Q0PD08 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab42Q0PD08 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab42Q0PD08 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab42Q0PD08 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab42Q0PD08 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab42Q0PD08 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab42Q0PD08 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab42Q0PD08 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rab42Q0PD08 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms