Protein–RNA interactions for Protein: Q06835

RDS3, Pre-mRNA-splicing factor RDS3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDS3Q06835 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt5.84□□□□□ -1.47
RDS3Q06835 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt5.84□□□□□ -1.47
RDS3Q06835 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt5.84□□□□□ -1.47
RDS3Q06835 BXI1YNL305C 894 nt5.84□□□□□ -1.47
RDS3Q06835 ALD5YER073W 1563 nt5.84□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 ELP4YPL101W 1371 nt5.83□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt5.83□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt5.83□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt5.83□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt5.83□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt5.83□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt5.83□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt5.83□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt5.83□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt5.83□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt5.83□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt5.83□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt5.83□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt5.83□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt5.83□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt5.83□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 YJR149WYJR149W 1215 nt5.83□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 MIM1YOL026C 342 nt5.83□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 RPS6AYPL090C 711 nt5.83□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 RPS6BYBR181C 711 nt5.83□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 YPR084WYPR084W 1371 nt5.82□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 EDC2YER035W 438 nt5.82□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 ATP2YJR121W 1536 nt5.82□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 YRF1-3YGR296W 5580 nt5.81□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 YRF1-6YNL339C 5580 nt5.81□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 YRF1-7YPL283C 5580 nt5.81□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 BUB2YMR055C 921 nt5.81□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 YOR268CYOR268C 399 nt5.81□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 FET5YFL041W 1869 nt5.81□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 YPT31YER031C 672 nt5.8□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 snR86snR86 1004 nt5.79□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 YMR206WYMR206W 942 nt5.79□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 RHO1YPR165W 630 nt5.79□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 YBR056WYBR056W 1506 nt5.79□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 MEX67YPL169C 1800 nt5.78□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 TDH1YJL052W 999 nt5.78□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 ADE1YAR015W 921 nt5.78□□□□□ -1.48
RDS3Q06835 HXT11YOL156W 1704 nt5.77□□□□□ -1.49
RDS3Q06835 PUP3YER094C 618 nt5.76□□□□□ -1.49
RDS3Q06835 ORT1YOR130C 879 nt5.76□□□□□ -1.49
RDS3Q06835 TOS1YBR162C 1368 nt5.76□□□□□ -1.49
RDS3Q06835 NUP53YMR153W 1428 nt5.75□□□□□ -1.49
RDS3Q06835 KAE1YKR038C 1161 nt5.75□□□□□ -1.49
RDS3Q06835 SHC1YER096W 1539 nt5.74□□□□□ -1.49
RDS3Q06835 YJL043WYJL043W 774 nt5.74□□□□□ -1.49
RDS3Q06835 FUS3YBL016W 1062 nt5.74□□□□□ -1.49
RDS3Q06835 MEP1YGR121C 1479 nt5.74□□□□□ -1.49
RDS3Q06835 THI73YLR004C 1572 nt5.74□□□□□ -1.49
RDS3Q06835 SRM1YGL097W 1449 nt5.74□□□□□ -1.49
RDS3Q06835 MFG1YDL233W 1377 nt5.73□□□□□ -1.49
RDS3Q06835 HBS1YKR084C 1836 nt5.72□□□□□ -1.49
RDS3Q06835 YIL168WYIL168W 384 nt5.72□□□□□ -1.49
RDS3Q06835 PMU1YKL128C 888 nt5.72□□□□□ -1.49
RDS3Q06835 LEA1YPL213W 717 nt5.72□□□□□ -1.49
RDS3Q06835 snR4snR4 186 nt5.72□□□□□ -1.49
RDS3Q06835 TIM50YPL063W 1431 nt5.72□□□□□ -1.49
RDS3Q06835 NDE2YDL085W 1638 nt5.71□□□□□ -1.5
RDS3Q06835 EHT1YBR177C 1356 nt5.71□□□□□ -1.5
RDS3Q06835 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt5.71□□□□□ -1.5
RDS3Q06835 HIS3YOR202W 663 nt5.71□□□□□ -1.5
RDS3Q06835 JHD1YER051W 1479 nt5.71□□□□□ -1.5
RDS3Q06835 PET494YNR045W 1470 nt5.71□□□□□ -1.5
RDS3Q06835 INO1YJL153C 1602 nt5.7□□□□□ -1.5
RDS3Q06835 PRE10YOR362C 867 nt5.7□□□□□ -1.5
RDS3Q06835 YIL177CYIL177C 5277 nt5.69□□□□□ -1.5
RDS3Q06835 LRO1YNR008W 1986 nt5.69□□□□□ -1.5
RDS3Q06835 FTH1YBR207W 1398 nt5.68□□□□□ -1.5
RDS3Q06835 HXT8YJL214W 1710 nt5.68□□□□□ -1.5
RDS3Q06835 YLR072WYLR072W 2082 nt5.68□□□□□ -1.5
RDS3Q06835 PSP2YML017W 1782 nt5.67□□□□□ -1.5
RDS3Q06835 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt5.67□□□□□ -1.5
RDS3Q06835 YNL140CYNL140C 570 nt5.67□□□□□ -1.5
RDS3Q06835 YDR476CYDR476C 675 nt5.66□□□□□ -1.5
RDS3Q06835 YGR137WYGR137W 375 nt5.66□□□□□ -1.5
RDS3Q06835 RCF1YML030W 480 nt5.66□□□□□ -1.5
RDS3Q06835 BAP3YDR046C 1815 nt5.66□□□□□ -1.5
RDS3Q06835 DUR3YHL016C 2208 nt5.65□□□□□ -1.5
RDS3Q06835 ABP1YCR088W 1779 nt5.65□□□□□ -1.51
RDS3Q06835 HAC1YFL031W 717 nt5.64□□□□□ -1.51
RDS3Q06835 RRT6YGL146C 936 nt5.64□□□□□ -1.51
RDS3Q06835 TIF3YPR163C 1311 nt5.64□□□□□ -1.51
RDS3Q06835 DIP5YPL265W 1827 nt5.63□□□□□ -1.51
RDS3Q06835 BUD31YCR063W 474 nt5.63□□□□□ -1.51
RDS3Q06835 INM1YHR046C 888 nt5.63□□□□□ -1.51
RDS3Q06835 PRE5YMR314W 705 nt5.63□□□□□ -1.51
RDS3Q06835 CPT1YNL130C 1182 nt5.63□□□□□ -1.51
RDS3Q06835 SFP1YLR403W 2052 nt5.63□□□□□ -1.51
RDS3Q06835 TGL5YOR081C 2250 nt5.62□□□□□ -1.51
RDS3Q06835 TDA4YJR116W 840 nt5.62□□□□□ -1.51
RDS3Q06835 HOG1YLR113W 1308 nt5.62□□□□□ -1.51
RDS3Q06835 SPR1YOR190W 1338 nt5.62□□□□□ -1.51
RDS3Q06835 MAS1YLR163C 1389 nt5.62□□□□□ -1.51
RDS3Q06835 DIA4YHR011W 1341 nt5.61□□□□□ -1.51
RDS3Q06835 ADE16YLR028C 1776 nt5.61□□□□□ -1.51
RDS3Q06835 ARG7YMR062C 1326 nt5.61□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 104.5 ms