Protein–RNA interactions for Protein: Q04228

UBX2, UBX domain-containing protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX2Q04228 GGA2YHR108W 1758 nt9.43□□□□□ -0.9
UBX2Q04228 ATP2YJR121W 1536 nt9.43□□□□□ -0.9
UBX2Q04228 YIL168WYIL168W 384 nt9.42□□□□□ -0.9
UBX2Q04228 YIR035CYIR035C 765 nt9.41□□□□□ -0.9
UBX2Q04228 RPC31YNL151C 756 nt9.41□□□□□ -0.9
UBX2Q04228 COS10YNR075W 1125 nt9.41□□□□□ -0.9
UBX2Q04228 RHO1YPR165W 630 nt9.4□□□□□ -0.9
UBX2Q04228 YBL095WYBL095W 813 nt9.39□□□□□ -0.91
UBX2Q04228 YLR358CYLR358C 564 nt9.38□□□□□ -0.91
UBX2Q04228 ILV2YMR108W 2064 nt9.38□□□□□ -0.91
UBX2Q04228 YHR218WYHR218W 1812 nt9.38□□□□□ -0.91
UBX2Q04228 RNA170RNA170 169 nt9.37□□□□□ -0.91
UBX2Q04228 ESBP6YNL125C 2022 nt9.37□□□□□ -0.91
UBX2Q04228 RPR1RPR1 369 nt9.36□□□□□ -0.91
UBX2Q04228 THI73YLR004C 1572 nt9.36□□□□□ -0.91
UBX2Q04228 RRT6YGL146C 936 nt9.35□□□□□ -0.91
UBX2Q04228 CWP2YKL096W-A 279 nt9.35□□□□□ -0.91
UBX2Q04228 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt9.35□□□□□ -0.91
UBX2Q04228 YOR072WYOR072W 315 nt9.33□□□□□ -0.92
UBX2Q04228 MDM35YKL053C-A 261 nt9.32□□□□□ -0.92
UBX2Q04228 BUB2YMR055C 921 nt9.32□□□□□ -0.92
UBX2Q04228 MTO1YGL236C 2010 nt9.32□□□□□ -0.92
UBX2Q04228 THI3YDL080C 1830 nt9.31□□□□□ -0.92
UBX2Q04228 PMU1YKL128C 888 nt9.31□□□□□ -0.92
UBX2Q04228 GPM1YKL152C 744 nt9.31□□□□□ -0.92
UBX2Q04228 YML079WYML079W 606 nt9.31□□□□□ -0.92
UBX2Q04228 PSP2YML017W 1782 nt9.31□□□□□ -0.92
UBX2Q04228 YDR467CYDR467C 327 nt9.3□□□□□ -0.92
UBX2Q04228 GAL2YLR081W 1725 nt9.3□□□□□ -0.92
UBX2Q04228 HAC1YFL031W 717 nt9.29□□□□□ -0.92
UBX2Q04228 PUP3YER094C 618 nt9.28□□□□□ -0.92
UBX2Q04228 YJL009WYJL009W 327 nt9.28□□□□□ -0.92
UBX2Q04228 TMS1YDR105C 1422 nt9.28□□□□□ -0.92
UBX2Q04228 MDL2YPL270W 2322 nt9.27□□□□□ -0.93
UBX2Q04228 PUP2YGR253C 783 nt9.26□□□□□ -0.93
UBX2Q04228 HXT10YFL011W 1641 nt9.26□□□□□ -0.93
UBX2Q04228 PRE10YOR362C 867 nt9.25□□□□□ -0.93
UBX2Q04228 DPL1YDR294C 1770 nt9.24□□□□□ -0.93
UBX2Q04228 CPT1YNL130C 1182 nt9.24□□□□□ -0.93
UBX2Q04228 AAC3YBR085W 924 nt9.23□□□□□ -0.93
UBX2Q04228 YMC2YBR104W 990 nt9.23□□□□□ -0.93
UBX2Q04228 MEX67YPL169C 1800 nt9.23□□□□□ -0.93
UBX2Q04228 URA1YKL216W 945 nt9.22□□□□□ -0.93
UBX2Q04228 MRS4YKR052C 915 nt9.22□□□□□ -0.93
UBX2Q04228 TOK1YJL093C 2076 nt9.22□□□□□ -0.93
UBX2Q04228 JHD1YER051W 1479 nt9.21□□□□□ -0.93
UBX2Q04228 SHC1YER096W 1539 nt9.21□□□□□ -0.93
UBX2Q04228 SPR1YOR190W 1338 nt9.21□□□□□ -0.94
UBX2Q04228 PNS1YOR161C 1620 nt9.2□□□□□ -0.94
UBX2Q04228 YRF1-2YER190W 5046 nt9.2□□□□□ -0.94
UBX2Q04228 DTR1YBR180W 1719 nt9.2□□□□□ -0.94
UBX2Q04228 TIM50YPL063W 1431 nt9.2□□□□□ -0.94
UBX2Q04228 RFC1YOR217W 2586 nt9.19□□□□□ -0.94
UBX2Q04228 MEP1YGR121C 1479 nt9.19□□□□□ -0.94
UBX2Q04228 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt9.18□□□□□ -0.94
UBX2Q04228 LAT1YNL071W 1449 nt9.16□□□□□ -0.94
UBX2Q04228 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt9.16□□□□□ -0.94
UBX2Q04228 LEU4YNL104C 1860 nt9.16□□□□□ -0.94
UBX2Q04228 AGP3YFL055W 1677 nt9.15□□□□□ -0.94
UBX2Q04228 INH1YDL181W 258 nt9.14□□□□□ -0.95
UBX2Q04228 SLM3YDL033C 1254 nt9.13□□□□□ -0.95
UBX2Q04228 YBR056WYBR056W 1506 nt9.12□□□□□ -0.95
UBX2Q04228 APT1YML022W 564 nt9.12□□□□□ -0.95
UBX2Q04228 TPN1YGL186C 1740 nt9.11□□□□□ -0.95
UBX2Q04228 YBL111CYBL111C 2004 nt9.11□□□□□ -0.95
UBX2Q04228 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt9.11□□□□□ -0.95
UBX2Q04228 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt9.11□□□□□ -0.95
UBX2Q04228 YOX1YML027W 1158 nt9.11□□□□□ -0.95
UBX2Q04228 PIH1YHR034C 1035 nt9.1□□□□□ -0.95
UBX2Q04228 NCA3YJL116C 1014 nt9.1□□□□□ -0.95
UBX2Q04228 RCF1YML030W 480 nt9.08□□□□□ -0.96
UBX2Q04228 ATP23YNR020C 813 nt9.08□□□□□ -0.96
UBX2Q04228 NBA1YOL070C 1506 nt9.08□□□□□ -0.96
UBX2Q04228 HXT8YJL214W 1710 nt9.06□□□□□ -0.96
UBX2Q04228 ARG7YMR062C 1326 nt9.05□□□□□ -0.96
UBX2Q04228 MAS2YHR024C 1449 nt9.05□□□□□ -0.96
UBX2Q04228 EHT1YBR177C 1356 nt9.03□□□□□ -0.96
UBX2Q04228 DOC1YGL240W 753 nt9.03□□□□□ -0.96
UBX2Q04228 UFD1YGR048W 1086 nt9.03□□□□□ -0.96
UBX2Q04228 YGR137WYGR137W 375 nt9.02□□□□□ -0.97
UBX2Q04228 YJL144WYJL144W 315 nt9.01□□□□□ -0.97
UBX2Q04228 LRO1YNR008W 1986 nt9.01□□□□□ -0.97
UBX2Q04228 LPD1YFL018C 1500 nt9□□□□□ -0.97
UBX2Q04228 AAT1YKL106W 1356 nt9□□□□□ -0.97
UBX2Q04228 snR86snR86 1004 nt9□□□□□ -0.97
UBX2Q04228 STS1YIR011C 960 nt8.99□□□□□ -0.97
UBX2Q04228 YOR111WYOR111W 699 nt8.99□□□□□ -0.97
UBX2Q04228 FIT1YDR534C 1587 nt8.99□□□□□ -0.97
UBX2Q04228 FRE6YLL051C 2139 nt8.98□□□□□ -0.97
UBX2Q04228 AIM46YHR199C 933 nt8.98□□□□□ -0.97
UBX2Q04228 CRN1YLR429W 1956 nt8.97□□□□□ -0.97
UBX2Q04228 SRY1YKL218C 981 nt8.97□□□□□ -0.97
UBX2Q04228 PTH2YBL057C 627 nt8.97□□□□□ -0.97
UBX2Q04228 NPP2YEL016C 1482 nt8.96□□□□□ -0.97
UBX2Q04228 YGL081WYGL081W 963 nt8.96□□□□□ -0.98
UBX2Q04228 ERV2YPR037C 591 nt8.96□□□□□ -0.98
UBX2Q04228 MSI1YBR195C 1269 nt8.96□□□□□ -0.98
UBX2Q04228 FET5YFL041W 1869 nt8.96□□□□□ -0.98
UBX2Q04228 YJR142WYJR142W 1029 nt8.95□□□□□ -0.98
UBX2Q04228 MIM1YOL026C 342 nt8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 47.7 ms