Protein–RNA interactions for Protein: P49919

Cdkn1c, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1cP49919 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdkn1cP49919 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdkn1cP49919 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdkn1cP49919 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdkn1cP49919 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdkn1cP49919 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdkn1cP49919 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdkn1cP49919 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdkn1cP49919 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdkn1cP49919 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdkn1cP49919 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdkn1cP49919 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdkn1cP49919 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cdkn1cP49919 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cdkn1cP49919 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdkn1cP49919 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdkn1cP49919 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdkn1cP49919 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdkn1cP49919 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdkn1cP49919 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdkn1cP49919 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdkn1cP49919 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdkn1cP49919 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdkn1cP49919 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdkn1cP49919 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdkn1cP49919 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdkn1cP49919 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdkn1cP49919 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdkn1cP49919 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdkn1cP49919 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdkn1cP49919 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdkn1cP49919 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdkn1cP49919 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdkn1cP49919 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdkn1cP49919 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdkn1cP49919 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdkn1cP49919 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdkn1cP49919 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdkn1cP49919 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdkn1cP49919 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdkn1cP49919 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdkn1cP49919 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdkn1cP49919 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdkn1cP49919 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdkn1cP49919 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdkn1cP49919 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdkn1cP49919 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdkn1cP49919 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdkn1cP49919 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdkn1cP49919 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdkn1cP49919 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdkn1cP49919 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdkn1cP49919 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdkn1cP49919 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdkn1cP49919 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdkn1cP49919 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdkn1cP49919 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdkn1cP49919 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdkn1cP49919 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdkn1cP49919 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdkn1cP49919 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdkn1cP49919 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdkn1cP49919 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdkn1cP49919 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdkn1cP49919 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdkn1cP49919 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdkn1cP49919 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdkn1cP49919 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdkn1cP49919 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdkn1cP49919 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdkn1cP49919 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdkn1cP49919 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdkn1cP49919 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdkn1cP49919 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdkn1cP49919 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdkn1cP49919 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdkn1cP49919 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdkn1cP49919 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdkn1cP49919 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdkn1cP49919 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdkn1cP49919 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdkn1cP49919 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdkn1cP49919 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdkn1cP49919 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdkn1cP49919 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdkn1cP49919 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Cdkn1cP49919 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cdkn1cP49919 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cdkn1cP49919 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdkn1cP49919 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdkn1cP49919 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdkn1cP49919 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdkn1cP49919 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdkn1cP49919 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdkn1cP49919 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdkn1cP49919 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdkn1cP49919 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdkn1cP49919 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdkn1cP49919 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdkn1cP49919 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms