Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gbx2P48031 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gbx2P48031 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gbx2P48031 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gbx2P48031 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gbx2P48031 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gbx2P48031 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gbx2P48031 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gbx2P48031 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gbx2P48031 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gbx2P48031 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gbx2P48031 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gbx2P48031 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gbx2P48031 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gbx2P48031 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gbx2P48031 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbx2P48031 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbx2P48031 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbx2P48031 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbx2P48031 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbx2P48031 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbx2P48031 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gbx2P48031 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gbx2P48031 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gbx2P48031 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gbx2P48031 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbx2P48031 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbx2P48031 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbx2P48031 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbx2P48031 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbx2P48031 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbx2P48031 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gbx2P48031 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gbx2P48031 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gbx2P48031 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbx2P48031 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbx2P48031 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gbx2P48031 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gbx2P48031 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gbx2P48031 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gbx2P48031 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gbx2P48031 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gbx2P48031 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gbx2P48031 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gbx2P48031 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gbx2P48031 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gbx2P48031 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gbx2P48031 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gbx2P48031 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gbx2P48031 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gbx2P48031 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gbx2P48031 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gbx2P48031 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gbx2P48031 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gbx2P48031 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gbx2P48031 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gbx2P48031 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gbx2P48031 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gbx2P48031 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gbx2P48031 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gbx2P48031 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gbx2P48031 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gbx2P48031 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gbx2P48031 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gbx2P48031 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gbx2P48031 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbx2P48031 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbx2P48031 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbx2P48031 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbx2P48031 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbx2P48031 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbx2P48031 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gbx2P48031 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbx2P48031 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbx2P48031 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbx2P48031 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbx2P48031 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbx2P48031 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbx2P48031 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbx2P48031 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbx2P48031 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbx2P48031 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbx2P48031 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbx2P48031 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbx2P48031 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbx2P48031 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbx2P48031 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbx2P48031 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbx2P48031 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbx2P48031 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbx2P48031 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbx2P48031 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbx2P48031 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbx2P48031 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbx2P48031 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbx2P48031 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbx2P48031 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbx2P48031 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gbx2P48031 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbx2P48031 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms