Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Elk1P41969 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Elk1P41969 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Elk1P41969 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Elk1P41969 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Elk1P41969 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Elk1P41969 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Elk1P41969 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Elk1P41969 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Elk1P41969 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Elk1P41969 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Elk1P41969 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Elk1P41969 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Elk1P41969 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Elk1P41969 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Elk1P41969 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Elk1P41969 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Elk1P41969 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Elk1P41969 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Elk1P41969 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Elk1P41969 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Elk1P41969 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Elk1P41969 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Elk1P41969 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Elk1P41969 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Elk1P41969 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Elk1P41969 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Elk1P41969 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Elk1P41969 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Elk1P41969 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Elk1P41969 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Elk1P41969 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Elk1P41969 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Elk1P41969 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Elk1P41969 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Elk1P41969 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Elk1P41969 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Elk1P41969 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Elk1P41969 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Elk1P41969 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Elk1P41969 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Elk1P41969 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Elk1P41969 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Elk1P41969 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Elk1P41969 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Elk1P41969 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Elk1P41969 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Elk1P41969 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Elk1P41969 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Elk1P41969 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Elk1P41969 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Elk1P41969 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Elk1P41969 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Elk1P41969 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Elk1P41969 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Elk1P41969 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Elk1P41969 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Elk1P41969 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Elk1P41969 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Elk1P41969 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Elk1P41969 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Elk1P41969 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Elk1P41969 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Elk1P41969 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Elk1P41969 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Elk1P41969 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Elk1P41969 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Elk1P41969 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Elk1P41969 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Elk1P41969 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Elk1P41969 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Elk1P41969 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Elk1P41969 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Elk1P41969 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Elk1P41969 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Elk1P41969 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Elk1P41969 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Elk1P41969 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Elk1P41969 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Elk1P41969 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Elk1P41969 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Elk1P41969 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Elk1P41969 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Elk1P41969 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Elk1P41969 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Elk1P41969 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Elk1P41969 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Elk1P41969 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Elk1P41969 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Elk1P41969 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Elk1P41969 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Elk1P41969 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Elk1P41969 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Elk1P41969 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elk1P41969 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elk1P41969 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Elk1P41969 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Elk1P41969 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Elk1P41969 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Elk1P41969 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms