Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gjb1P28230 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gjb1P28230 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gjb1P28230 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gjb1P28230 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Gjb1P28230 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Gjb1P28230 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gjb1P28230 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gjb1P28230 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gjb1P28230 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Gjb1P28230 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gjb1P28230 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gjb1P28230 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Gjb1P28230 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gjb1P28230 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gjb1P28230 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Gjb1P28230 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gjb1P28230 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Gjb1P28230 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gjb1P28230 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gjb1P28230 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gjb1P28230 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gjb1P28230 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Gjb1P28230 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gjb1P28230 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gjb1P28230 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gjb1P28230 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gjb1P28230 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gjb1P28230 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gjb1P28230 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gjb1P28230 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gjb1P28230 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Gjb1P28230 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gjb1P28230 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gjb1P28230 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gjb1P28230 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gjb1P28230 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gjb1P28230 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Gjb1P28230 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gjb1P28230 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gjb1P28230 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gjb1P28230 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gjb1P28230 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gjb1P28230 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gjb1P28230 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Gjb1P28230 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gjb1P28230 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gjb1P28230 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gjb1P28230 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gjb1P28230 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gjb1P28230 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gjb1P28230 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gjb1P28230 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gjb1P28230 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gjb1P28230 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gjb1P28230 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gjb1P28230 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gjb1P28230 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gjb1P28230 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gjb1P28230 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gjb1P28230 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gjb1P28230 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gjb1P28230 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gjb1P28230 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Gjb1P28230 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gjb1P28230 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gjb1P28230 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gjb1P28230 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gjb1P28230 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Gjb1P28230 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gjb1P28230 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gjb1P28230 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gjb1P28230 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Gjb1P28230 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gjb1P28230 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Gjb1P28230 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gjb1P28230 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gjb1P28230 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gjb1P28230 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gjb1P28230 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gjb1P28230 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gjb1P28230 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gjb1P28230 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gjb1P28230 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Gjb1P28230 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gjb1P28230 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gjb1P28230 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gjb1P28230 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gjb1P28230 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gjb1P28230 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gjb1P28230 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gjb1P28230 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gjb1P28230 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gjb1P28230 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gjb1P28230 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gjb1P28230 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gjb1P28230 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gjb1P28230 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gjb1P28230 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Gjb1P28230 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms