Protein–RNA interactions for Protein: P12672

Rapsn, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RapsnP12672 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RapsnP12672 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RapsnP12672 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RapsnP12672 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RapsnP12672 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RapsnP12672 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RapsnP12672 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RapsnP12672 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RapsnP12672 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RapsnP12672 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RapsnP12672 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RapsnP12672 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RapsnP12672 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RapsnP12672 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RapsnP12672 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RapsnP12672 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RapsnP12672 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RapsnP12672 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RapsnP12672 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RapsnP12672 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RapsnP12672 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RapsnP12672 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RapsnP12672 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RapsnP12672 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RapsnP12672 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RapsnP12672 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RapsnP12672 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RapsnP12672 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RapsnP12672 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RapsnP12672 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RapsnP12672 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RapsnP12672 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RapsnP12672 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RapsnP12672 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RapsnP12672 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RapsnP12672 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RapsnP12672 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RapsnP12672 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RapsnP12672 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RapsnP12672 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RapsnP12672 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RapsnP12672 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RapsnP12672 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RapsnP12672 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RapsnP12672 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RapsnP12672 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RapsnP12672 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RapsnP12672 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RapsnP12672 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RapsnP12672 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RapsnP12672 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RapsnP12672 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RapsnP12672 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RapsnP12672 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RapsnP12672 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RapsnP12672 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RapsnP12672 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RapsnP12672 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RapsnP12672 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RapsnP12672 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RapsnP12672 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RapsnP12672 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RapsnP12672 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RapsnP12672 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RapsnP12672 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RapsnP12672 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RapsnP12672 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RapsnP12672 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RapsnP12672 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RapsnP12672 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RapsnP12672 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RapsnP12672 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RapsnP12672 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RapsnP12672 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RapsnP12672 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RapsnP12672 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RapsnP12672 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RapsnP12672 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RapsnP12672 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RapsnP12672 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RapsnP12672 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RapsnP12672 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RapsnP12672 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RapsnP12672 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RapsnP12672 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RapsnP12672 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RapsnP12672 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RapsnP12672 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RapsnP12672 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RapsnP12672 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RapsnP12672 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RapsnP12672 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RapsnP12672 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RapsnP12672 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RapsnP12672 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RapsnP12672 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RapsnP12672 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RapsnP12672 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RapsnP12672 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RapsnP12672 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms