Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
GLI2P10070 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
GLI2P10070 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
GLI2P10070 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC40.55■■■■■ 4.08
GLI2P10070 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC40.54■■■■■ 4.08
GLI2P10070 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
GLI2P10070 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC40.54■■■■■ 4.08
GLI2P10070 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
GLI2P10070 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
GLI2P10070 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
GLI2P10070 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
GLI2P10070 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC40.48■■■■■ 4.07
GLI2P10070 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
GLI2P10070 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
GLI2P10070 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
GLI2P10070 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
GLI2P10070 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
GLI2P10070 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
GLI2P10070 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
GLI2P10070 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
GLI2P10070 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
GLI2P10070 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
GLI2P10070 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
GLI2P10070 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
GLI2P10070 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
GLI2P10070 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
GLI2P10070 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
GLI2P10070 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
GLI2P10070 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
GLI2P10070 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
GLI2P10070 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
GLI2P10070 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
GLI2P10070 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC40.38■■■■■ 4.05
GLI2P10070 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
GLI2P10070 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
GLI2P10070 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
GLI2P10070 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
GLI2P10070 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
GLI2P10070 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
GLI2P10070 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
GLI2P10070 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
GLI2P10070 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
GLI2P10070 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
GLI2P10070 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
GLI2P10070 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
GLI2P10070 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
GLI2P10070 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
GLI2P10070 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC40.32■■■■■ 4.05
GLI2P10070 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC40.32■■■■■ 4.05
GLI2P10070 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
GLI2P10070 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
GLI2P10070 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
GLI2P10070 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
GLI2P10070 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
GLI2P10070 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
GLI2P10070 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
GLI2P10070 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
GLI2P10070 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
GLI2P10070 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
GLI2P10070 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
GLI2P10070 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
GLI2P10070 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
GLI2P10070 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC40.27■■■■■ 4.04
GLI2P10070 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC40.27■■■■■ 4.04
GLI2P10070 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
GLI2P10070 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC40.25■■■■■ 4.03
GLI2P10070 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
GLI2P10070 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
GLI2P10070 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
GLI2P10070 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
GLI2P10070 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
GLI2P10070 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
GLI2P10070 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
GLI2P10070 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
GLI2P10070 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
GLI2P10070 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
GLI2P10070 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
GLI2P10070 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
GLI2P10070 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
GLI2P10070 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC40.19■■■■■ 4.02
GLI2P10070 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
GLI2P10070 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
GLI2P10070 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
GLI2P10070 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
GLI2P10070 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
GLI2P10070 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
GLI2P10070 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
GLI2P10070 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
GLI2P10070 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
GLI2P10070 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
GLI2P10070 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
GLI2P10070 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
GLI2P10070 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
GLI2P10070 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
GLI2P10070 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
GLI2P10070 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
GLI2P10070 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
GLI2P10070 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
GLI2P10070 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
GLI2P10070 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms