Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Surf1P09925 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Surf1P09925 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Surf1P09925 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Surf1P09925 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Surf1P09925 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Surf1P09925 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Surf1P09925 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Surf1P09925 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Surf1P09925 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Surf1P09925 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Surf1P09925 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Surf1P09925 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Surf1P09925 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Surf1P09925 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Surf1P09925 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Surf1P09925 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Surf1P09925 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Surf1P09925 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Surf1P09925 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Surf1P09925 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Surf1P09925 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Surf1P09925 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Surf1P09925 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Surf1P09925 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Surf1P09925 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Surf1P09925 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Surf1P09925 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Surf1P09925 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Surf1P09925 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Surf1P09925 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Surf1P09925 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Surf1P09925 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Surf1P09925 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Surf1P09925 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Surf1P09925 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Surf1P09925 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Surf1P09925 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Surf1P09925 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Surf1P09925 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Surf1P09925 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Surf1P09925 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Surf1P09925 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Surf1P09925 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Surf1P09925 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Surf1P09925 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Surf1P09925 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Surf1P09925 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Surf1P09925 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Surf1P09925 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Surf1P09925 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Surf1P09925 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Surf1P09925 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Surf1P09925 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Surf1P09925 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Surf1P09925 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Surf1P09925 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Surf1P09925 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Surf1P09925 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Surf1P09925 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Surf1P09925 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Surf1P09925 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Surf1P09925 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Surf1P09925 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Surf1P09925 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Surf1P09925 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Surf1P09925 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Surf1P09925 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Surf1P09925 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Surf1P09925 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Surf1P09925 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Surf1P09925 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Surf1P09925 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Surf1P09925 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Surf1P09925 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Surf1P09925 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Surf1P09925 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Surf1P09925 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Surf1P09925 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Surf1P09925 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Surf1P09925 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Surf1P09925 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Surf1P09925 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Surf1P09925 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Surf1P09925 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Surf1P09925 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Surf1P09925 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Surf1P09925 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Surf1P09925 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Surf1P09925 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Surf1P09925 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Surf1P09925 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Surf1P09925 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Surf1P09925 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Surf1P09925 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Surf1P09925 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Surf1P09925 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Surf1P09925 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Surf1P09925 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Surf1P09925 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms