Protein–RNA interactions for Protein: P02772

Afp, Alpha-fetoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AfpP02772 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AfpP02772 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AfpP02772 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AfpP02772 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AfpP02772 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AfpP02772 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AfpP02772 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AfpP02772 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AfpP02772 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AfpP02772 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AfpP02772 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AfpP02772 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AfpP02772 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AfpP02772 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AfpP02772 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AfpP02772 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AfpP02772 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AfpP02772 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AfpP02772 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AfpP02772 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AfpP02772 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AfpP02772 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AfpP02772 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AfpP02772 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AfpP02772 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AfpP02772 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AfpP02772 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AfpP02772 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AfpP02772 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AfpP02772 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AfpP02772 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AfpP02772 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AfpP02772 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AfpP02772 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AfpP02772 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AfpP02772 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
AfpP02772 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AfpP02772 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AfpP02772 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
AfpP02772 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AfpP02772 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AfpP02772 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AfpP02772 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
AfpP02772 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AfpP02772 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AfpP02772 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AfpP02772 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AfpP02772 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AfpP02772 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AfpP02772 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AfpP02772 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AfpP02772 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AfpP02772 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AfpP02772 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AfpP02772 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AfpP02772 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AfpP02772 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AfpP02772 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AfpP02772 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AfpP02772 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AfpP02772 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AfpP02772 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
AfpP02772 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
AfpP02772 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AfpP02772 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AfpP02772 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AfpP02772 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AfpP02772 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AfpP02772 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AfpP02772 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AfpP02772 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AfpP02772 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AfpP02772 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AfpP02772 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AfpP02772 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AfpP02772 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AfpP02772 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AfpP02772 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AfpP02772 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AfpP02772 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AfpP02772 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AfpP02772 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AfpP02772 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AfpP02772 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AfpP02772 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AfpP02772 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AfpP02772 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
AfpP02772 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AfpP02772 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AfpP02772 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AfpP02772 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
AfpP02772 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AfpP02772 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AfpP02772 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AfpP02772 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AfpP02772 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AfpP02772 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AfpP02772 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AfpP02772 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AfpP02772 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms