Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngr2O55101 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngr2O55101 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngr2O55101 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngr2O55101 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngr2O55101 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngr2O55101 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngr2O55101 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syngr2O55101 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syngr2O55101 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syngr2O55101 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngr2O55101 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngr2O55101 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngr2O55101 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngr2O55101 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngr2O55101 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngr2O55101 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngr2O55101 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngr2O55101 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngr2O55101 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngr2O55101 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngr2O55101 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngr2O55101 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngr2O55101 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngr2O55101 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngr2O55101 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngr2O55101 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngr2O55101 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngr2O55101 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngr2O55101 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngr2O55101 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngr2O55101 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngr2O55101 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngr2O55101 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngr2O55101 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngr2O55101 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngr2O55101 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syngr2O55101 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Syngr2O55101 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syngr2O55101 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngr2O55101 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngr2O55101 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngr2O55101 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngr2O55101 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngr2O55101 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngr2O55101 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngr2O55101 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngr2O55101 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngr2O55101 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngr2O55101 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngr2O55101 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngr2O55101 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngr2O55101 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngr2O55101 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngr2O55101 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngr2O55101 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngr2O55101 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngr2O55101 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms