Protein–RNA interactions for Protein: O54984

Asna1, ATPase Asna1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asna1O54984 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Asna1O54984 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Asna1O54984 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Asna1O54984 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Asna1O54984 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Asna1O54984 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Asna1O54984 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Asna1O54984 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Asna1O54984 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Asna1O54984 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Asna1O54984 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Asna1O54984 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Asna1O54984 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Asna1O54984 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Asna1O54984 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Asna1O54984 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Asna1O54984 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Asna1O54984 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Asna1O54984 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Asna1O54984 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Asna1O54984 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Asna1O54984 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Asna1O54984 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Asna1O54984 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Asna1O54984 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Asna1O54984 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Asna1O54984 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Asna1O54984 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Asna1O54984 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Asna1O54984 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Asna1O54984 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Asna1O54984 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Asna1O54984 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Asna1O54984 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Asna1O54984 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Asna1O54984 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Asna1O54984 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Asna1O54984 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Asna1O54984 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Asna1O54984 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Asna1O54984 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Asna1O54984 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Asna1O54984 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Asna1O54984 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Asna1O54984 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Asna1O54984 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Asna1O54984 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Asna1O54984 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Asna1O54984 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Asna1O54984 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Asna1O54984 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Asna1O54984 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Asna1O54984 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Asna1O54984 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Asna1O54984 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Asna1O54984 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Asna1O54984 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Asna1O54984 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Asna1O54984 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Asna1O54984 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Asna1O54984 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Asna1O54984 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Asna1O54984 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Asna1O54984 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Asna1O54984 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Asna1O54984 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Asna1O54984 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Asna1O54984 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Asna1O54984 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Asna1O54984 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Asna1O54984 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Asna1O54984 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Asna1O54984 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Asna1O54984 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Asna1O54984 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Asna1O54984 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Asna1O54984 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Asna1O54984 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Asna1O54984 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Asna1O54984 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Asna1O54984 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Asna1O54984 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Asna1O54984 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Asna1O54984 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Asna1O54984 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Asna1O54984 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Asna1O54984 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Asna1O54984 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Asna1O54984 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Asna1O54984 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Asna1O54984 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Asna1O54984 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Asna1O54984 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Asna1O54984 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Asna1O54984 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Asna1O54984 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Asna1O54984 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Asna1O54984 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Asna1O54984 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Asna1O54984 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms