Protein–RNA interactions for Protein: O35492

Clk3, Dual specificity protein kinase CLK3, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk3O35492 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clk3O35492 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clk3O35492 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clk3O35492 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clk3O35492 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clk3O35492 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clk3O35492 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clk3O35492 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clk3O35492 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clk3O35492 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clk3O35492 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clk3O35492 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Clk3O35492 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clk3O35492 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clk3O35492 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clk3O35492 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clk3O35492 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clk3O35492 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clk3O35492 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clk3O35492 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clk3O35492 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clk3O35492 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clk3O35492 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clk3O35492 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clk3O35492 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clk3O35492 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clk3O35492 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clk3O35492 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clk3O35492 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clk3O35492 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clk3O35492 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clk3O35492 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clk3O35492 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clk3O35492 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clk3O35492 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clk3O35492 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clk3O35492 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clk3O35492 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clk3O35492 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clk3O35492 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clk3O35492 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clk3O35492 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clk3O35492 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clk3O35492 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clk3O35492 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clk3O35492 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clk3O35492 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clk3O35492 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clk3O35492 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clk3O35492 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clk3O35492 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clk3O35492 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clk3O35492 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clk3O35492 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clk3O35492 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clk3O35492 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clk3O35492 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clk3O35492 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clk3O35492 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clk3O35492 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clk3O35492 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clk3O35492 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clk3O35492 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clk3O35492 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clk3O35492 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clk3O35492 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clk3O35492 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clk3O35492 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clk3O35492 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clk3O35492 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Clk3O35492 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clk3O35492 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clk3O35492 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clk3O35492 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Clk3O35492 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clk3O35492 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clk3O35492 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clk3O35492 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clk3O35492 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clk3O35492 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clk3O35492 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clk3O35492 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clk3O35492 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clk3O35492 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Clk3O35492 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clk3O35492 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clk3O35492 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clk3O35492 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clk3O35492 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clk3O35492 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clk3O35492 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clk3O35492 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clk3O35492 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Clk3O35492 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clk3O35492 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clk3O35492 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Clk3O35492 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clk3O35492 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clk3O35492 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clk3O35492 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms