Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Vwa3bJ9JI28 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Vwa3bJ9JI28 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vwa3bJ9JI28 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vwa3bJ9JI28 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vwa3bJ9JI28 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Vwa3bJ9JI28 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vwa3bJ9JI28 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vwa3bJ9JI28 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vwa3bJ9JI28 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vwa3bJ9JI28 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vwa3bJ9JI28 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vwa3bJ9JI28 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vwa3bJ9JI28 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vwa3bJ9JI28 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vwa3bJ9JI28 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vwa3bJ9JI28 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Vwa3bJ9JI28 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vwa3bJ9JI28 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vwa3bJ9JI28 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vwa3bJ9JI28 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vwa3bJ9JI28 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vwa3bJ9JI28 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vwa3bJ9JI28 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vwa3bJ9JI28 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vwa3bJ9JI28 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Vwa3bJ9JI28 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Vwa3bJ9JI28 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Vwa3bJ9JI28 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Vwa3bJ9JI28 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Vwa3bJ9JI28 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Vwa3bJ9JI28 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Vwa3bJ9JI28 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Vwa3bJ9JI28 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vwa3bJ9JI28 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vwa3bJ9JI28 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vwa3bJ9JI28 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vwa3bJ9JI28 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vwa3bJ9JI28 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vwa3bJ9JI28 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vwa3bJ9JI28 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vwa3bJ9JI28 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vwa3bJ9JI28 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vwa3bJ9JI28 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vwa3bJ9JI28 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vwa3bJ9JI28 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vwa3bJ9JI28 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Vwa3bJ9JI28 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Vwa3bJ9JI28 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vwa3bJ9JI28 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vwa3bJ9JI28 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vwa3bJ9JI28 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vwa3bJ9JI28 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Vwa3bJ9JI28 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vwa3bJ9JI28 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vwa3bJ9JI28 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vwa3bJ9JI28 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vwa3bJ9JI28 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vwa3bJ9JI28 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vwa3bJ9JI28 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vwa3bJ9JI28 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vwa3bJ9JI28 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vwa3bJ9JI28 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vwa3bJ9JI28 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vwa3bJ9JI28 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vwa3bJ9JI28 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vwa3bJ9JI28 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vwa3bJ9JI28 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vwa3bJ9JI28 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vwa3bJ9JI28 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vwa3bJ9JI28 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vwa3bJ9JI28 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vwa3bJ9JI28 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vwa3bJ9JI28 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vwa3bJ9JI28 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vwa3bJ9JI28 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vwa3bJ9JI28 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vwa3bJ9JI28 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vwa3bJ9JI28 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vwa3bJ9JI28 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vwa3bJ9JI28 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vwa3bJ9JI28 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vwa3bJ9JI28 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vwa3bJ9JI28 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vwa3bJ9JI28 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vwa3bJ9JI28 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vwa3bJ9JI28 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vwa3bJ9JI28 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vwa3bJ9JI28 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vwa3bJ9JI28 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Vwa3bJ9JI28 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Vwa3bJ9JI28 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Vwa3bJ9JI28 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Vwa3bJ9JI28 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Vwa3bJ9JI28 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Vwa3bJ9JI28 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Vwa3bJ9JI28 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Vwa3bJ9JI28 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vwa3bJ9JI28 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vwa3bJ9JI28 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms