Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
4930544D05RikJ3QK56 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
4930544D05RikJ3QK56 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
4930544D05RikJ3QK56 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
4930544D05RikJ3QK56 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
4930544D05RikJ3QK56 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
4930544D05RikJ3QK56 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
4930544D05RikJ3QK56 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
4930544D05RikJ3QK56 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
4930544D05RikJ3QK56 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
4930544D05RikJ3QK56 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
4930544D05RikJ3QK56 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
4930544D05RikJ3QK56 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
4930544D05RikJ3QK56 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
4930544D05RikJ3QK56 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
4930544D05RikJ3QK56 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
4930544D05RikJ3QK56 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4930544D05RikJ3QK56 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
4930544D05RikJ3QK56 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4930544D05RikJ3QK56 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4930544D05RikJ3QK56 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930544D05RikJ3QK56 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930544D05RikJ3QK56 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930544D05RikJ3QK56 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930544D05RikJ3QK56 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930544D05RikJ3QK56 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930544D05RikJ3QK56 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930544D05RikJ3QK56 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930544D05RikJ3QK56 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930544D05RikJ3QK56 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930544D05RikJ3QK56 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930544D05RikJ3QK56 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930544D05RikJ3QK56 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930544D05RikJ3QK56 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930544D05RikJ3QK56 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930544D05RikJ3QK56 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930544D05RikJ3QK56 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930544D05RikJ3QK56 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930544D05RikJ3QK56 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930544D05RikJ3QK56 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930544D05RikJ3QK56 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930544D05RikJ3QK56 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930544D05RikJ3QK56 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930544D05RikJ3QK56 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930544D05RikJ3QK56 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930544D05RikJ3QK56 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930544D05RikJ3QK56 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
4930544D05RikJ3QK56 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4930544D05RikJ3QK56 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4930544D05RikJ3QK56 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
4930544D05RikJ3QK56 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930544D05RikJ3QK56 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930544D05RikJ3QK56 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930544D05RikJ3QK56 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930544D05RikJ3QK56 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930544D05RikJ3QK56 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930544D05RikJ3QK56 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930544D05RikJ3QK56 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
4930544D05RikJ3QK56 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930544D05RikJ3QK56 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930544D05RikJ3QK56 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930544D05RikJ3QK56 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930544D05RikJ3QK56 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
4930544D05RikJ3QK56 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
4930544D05RikJ3QK56 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930544D05RikJ3QK56 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
4930544D05RikJ3QK56 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4930544D05RikJ3QK56 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
4930544D05RikJ3QK56 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
4930544D05RikJ3QK56 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
4930544D05RikJ3QK56 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
4930544D05RikJ3QK56 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
4930544D05RikJ3QK56 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
4930544D05RikJ3QK56 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930544D05RikJ3QK56 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930544D05RikJ3QK56 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
4930544D05RikJ3QK56 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930544D05RikJ3QK56 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
4930544D05RikJ3QK56 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930544D05RikJ3QK56 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930544D05RikJ3QK56 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930544D05RikJ3QK56 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
4930544D05RikJ3QK56 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
4930544D05RikJ3QK56 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
4930544D05RikJ3QK56 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
4930544D05RikJ3QK56 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
4930544D05RikJ3QK56 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
4930544D05RikJ3QK56 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930544D05RikJ3QK56 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930544D05RikJ3QK56 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
4930544D05RikJ3QK56 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
4930544D05RikJ3QK56 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930544D05RikJ3QK56 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930544D05RikJ3QK56 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930544D05RikJ3QK56 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930544D05RikJ3QK56 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930544D05RikJ3QK56 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930544D05RikJ3QK56 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
4930544D05RikJ3QK56 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms