Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r68E9Q0V3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r68E9Q0V3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r68E9Q0V3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r68E9Q0V3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r68E9Q0V3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r68E9Q0V3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r68E9Q0V3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r68E9Q0V3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r68E9Q0V3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r68E9Q0V3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r68E9Q0V3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r68E9Q0V3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r68E9Q0V3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r68E9Q0V3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r68E9Q0V3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r68E9Q0V3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r68E9Q0V3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r68E9Q0V3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r68E9Q0V3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r68E9Q0V3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r68E9Q0V3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r68E9Q0V3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r68E9Q0V3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r68E9Q0V3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r68E9Q0V3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r68E9Q0V3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r68E9Q0V3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r68E9Q0V3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r68E9Q0V3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r68E9Q0V3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn1r68E9Q0V3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn1r68E9Q0V3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r68E9Q0V3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r68E9Q0V3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r68E9Q0V3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r68E9Q0V3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r68E9Q0V3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r68E9Q0V3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r68E9Q0V3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r68E9Q0V3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r68E9Q0V3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r68E9Q0V3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r68E9Q0V3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r68E9Q0V3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r68E9Q0V3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r68E9Q0V3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r68E9Q0V3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r68E9Q0V3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r68E9Q0V3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r68E9Q0V3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r68E9Q0V3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r68E9Q0V3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r68E9Q0V3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r68E9Q0V3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r68E9Q0V3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r68E9Q0V3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r68E9Q0V3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r68E9Q0V3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r68E9Q0V3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r68E9Q0V3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r68E9Q0V3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r68E9Q0V3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r68E9Q0V3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r68E9Q0V3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r68E9Q0V3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r68E9Q0V3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r68E9Q0V3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r68E9Q0V3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r68E9Q0V3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r68E9Q0V3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r68E9Q0V3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r68E9Q0V3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r68E9Q0V3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r68E9Q0V3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r68E9Q0V3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r68E9Q0V3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r68E9Q0V3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r68E9Q0V3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r68E9Q0V3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r68E9Q0V3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r68E9Q0V3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r68E9Q0V3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r68E9Q0V3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vmn1r68E9Q0V3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r68E9Q0V3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r68E9Q0V3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r68E9Q0V3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r68E9Q0V3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r68E9Q0V3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r68E9Q0V3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r68E9Q0V3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r68E9Q0V3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r68E9Q0V3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r68E9Q0V3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r68E9Q0V3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r68E9Q0V3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms