Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Scaf11E9PZM7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Scaf11E9PZM7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Scaf11E9PZM7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Scaf11E9PZM7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Scaf11E9PZM7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Scaf11E9PZM7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Scaf11E9PZM7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Scaf11E9PZM7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Scaf11E9PZM7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Scaf11E9PZM7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Scaf11E9PZM7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Scaf11E9PZM7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Scaf11E9PZM7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Scaf11E9PZM7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Scaf11E9PZM7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Scaf11E9PZM7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Scaf11E9PZM7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Scaf11E9PZM7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Scaf11E9PZM7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Scaf11E9PZM7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Scaf11E9PZM7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Scaf11E9PZM7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Scaf11E9PZM7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Scaf11E9PZM7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Scaf11E9PZM7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Scaf11E9PZM7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Scaf11E9PZM7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Scaf11E9PZM7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Scaf11E9PZM7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Scaf11E9PZM7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Scaf11E9PZM7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Scaf11E9PZM7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Scaf11E9PZM7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Scaf11E9PZM7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Scaf11E9PZM7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Scaf11E9PZM7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Scaf11E9PZM7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Scaf11E9PZM7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Scaf11E9PZM7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Scaf11E9PZM7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Scaf11E9PZM7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Scaf11E9PZM7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Scaf11E9PZM7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Scaf11E9PZM7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Scaf11E9PZM7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Scaf11E9PZM7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Scaf11E9PZM7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Scaf11E9PZM7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Scaf11E9PZM7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Scaf11E9PZM7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Scaf11E9PZM7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Scaf11E9PZM7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Scaf11E9PZM7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Scaf11E9PZM7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Scaf11E9PZM7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Scaf11E9PZM7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Scaf11E9PZM7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Scaf11E9PZM7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Scaf11E9PZM7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Scaf11E9PZM7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Scaf11E9PZM7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Scaf11E9PZM7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Scaf11E9PZM7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Scaf11E9PZM7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Scaf11E9PZM7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Scaf11E9PZM7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Scaf11E9PZM7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Scaf11E9PZM7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
Scaf11E9PZM7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Scaf11E9PZM7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Scaf11E9PZM7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Scaf11E9PZM7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Scaf11E9PZM7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Scaf11E9PZM7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Scaf11E9PZM7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Scaf11E9PZM7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Scaf11E9PZM7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Scaf11E9PZM7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Scaf11E9PZM7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Scaf11E9PZM7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Scaf11E9PZM7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Scaf11E9PZM7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Scaf11E9PZM7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Scaf11E9PZM7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Scaf11E9PZM7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Scaf11E9PZM7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Scaf11E9PZM7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Scaf11E9PZM7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Scaf11E9PZM7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Scaf11E9PZM7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Scaf11E9PZM7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Scaf11E9PZM7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Scaf11E9PZM7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Scaf11E9PZM7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Scaf11E9PZM7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Scaf11E9PZM7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Scaf11E9PZM7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
Scaf11E9PZM7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Scaf11E9PZM7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms