Protein–RNA interactions for Protein: B8JK39

Itga9, Integrin alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga9B8JK39 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itga9B8JK39 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itga9B8JK39 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itga9B8JK39 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itga9B8JK39 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itga9B8JK39 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itga9B8JK39 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itga9B8JK39 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itga9B8JK39 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itga9B8JK39 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itga9B8JK39 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itga9B8JK39 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itga9B8JK39 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itga9B8JK39 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itga9B8JK39 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itga9B8JK39 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itga9B8JK39 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itga9B8JK39 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itga9B8JK39 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Itga9B8JK39 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itga9B8JK39 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itga9B8JK39 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itga9B8JK39 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Itga9B8JK39 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itga9B8JK39 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itga9B8JK39 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itga9B8JK39 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itga9B8JK39 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itga9B8JK39 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itga9B8JK39 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itga9B8JK39 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itga9B8JK39 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itga9B8JK39 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itga9B8JK39 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itga9B8JK39 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itga9B8JK39 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itga9B8JK39 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itga9B8JK39 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itga9B8JK39 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itga9B8JK39 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itga9B8JK39 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itga9B8JK39 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itga9B8JK39 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itga9B8JK39 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itga9B8JK39 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga9B8JK39 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga9B8JK39 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga9B8JK39 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga9B8JK39 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga9B8JK39 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga9B8JK39 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itga9B8JK39 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itga9B8JK39 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itga9B8JK39 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Itga9B8JK39 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Itga9B8JK39 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itga9B8JK39 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itga9B8JK39 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itga9B8JK39 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itga9B8JK39 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itga9B8JK39 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itga9B8JK39 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga9B8JK39 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga9B8JK39 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga9B8JK39 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itga9B8JK39 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itga9B8JK39 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Itga9B8JK39 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga9B8JK39 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga9B8JK39 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga9B8JK39 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga9B8JK39 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itga9B8JK39 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itga9B8JK39 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga9B8JK39 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga9B8JK39 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga9B8JK39 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga9B8JK39 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga9B8JK39 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itga9B8JK39 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itga9B8JK39 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga9B8JK39 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga9B8JK39 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga9B8JK39 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga9B8JK39 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itga9B8JK39 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itga9B8JK39 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itga9B8JK39 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itga9B8JK39 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga9B8JK39 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga9B8JK39 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga9B8JK39 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga9B8JK39 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itga9B8JK39 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itga9B8JK39 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itga9B8JK39 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itga9B8JK39 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itga9B8JK39 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itga9B8JK39 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itga9B8JK39 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 267.5 ms