Protein–RNA interactions for Protein: B1AZ99

Otud3, OTU domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud3B1AZ99 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Otud3B1AZ99 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Otud3B1AZ99 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Otud3B1AZ99 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Otud3B1AZ99 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Otud3B1AZ99 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otud3B1AZ99 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otud3B1AZ99 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otud3B1AZ99 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otud3B1AZ99 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otud3B1AZ99 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud3B1AZ99 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud3B1AZ99 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud3B1AZ99 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud3B1AZ99 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otud3B1AZ99 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud3B1AZ99 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud3B1AZ99 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud3B1AZ99 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud3B1AZ99 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud3B1AZ99 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud3B1AZ99 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud3B1AZ99 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud3B1AZ99 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud3B1AZ99 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud3B1AZ99 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud3B1AZ99 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud3B1AZ99 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud3B1AZ99 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud3B1AZ99 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud3B1AZ99 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud3B1AZ99 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud3B1AZ99 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud3B1AZ99 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud3B1AZ99 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Otud3B1AZ99 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Otud3B1AZ99 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud3B1AZ99 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud3B1AZ99 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud3B1AZ99 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud3B1AZ99 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud3B1AZ99 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud3B1AZ99 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud3B1AZ99 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud3B1AZ99 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud3B1AZ99 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud3B1AZ99 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud3B1AZ99 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud3B1AZ99 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud3B1AZ99 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud3B1AZ99 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud3B1AZ99 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud3B1AZ99 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud3B1AZ99 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud3B1AZ99 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud3B1AZ99 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Otud3B1AZ99 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otud3B1AZ99 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otud3B1AZ99 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otud3B1AZ99 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otud3B1AZ99 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otud3B1AZ99 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otud3B1AZ99 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otud3B1AZ99 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otud3B1AZ99 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otud3B1AZ99 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Otud3B1AZ99 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Otud3B1AZ99 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Otud3B1AZ99 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Otud3B1AZ99 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otud3B1AZ99 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otud3B1AZ99 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otud3B1AZ99 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otud3B1AZ99 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otud3B1AZ99 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Otud3B1AZ99 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Otud3B1AZ99 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Otud3B1AZ99 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Otud3B1AZ99 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud3B1AZ99 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud3B1AZ99 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud3B1AZ99 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud3B1AZ99 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud3B1AZ99 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud3B1AZ99 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud3B1AZ99 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud3B1AZ99 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud3B1AZ99 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud3B1AZ99 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud3B1AZ99 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud3B1AZ99 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud3B1AZ99 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud3B1AZ99 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud3B1AZ99 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otud3B1AZ99 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otud3B1AZ99 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otud3B1AZ99 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud3B1AZ99 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud3B1AZ99 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud3B1AZ99 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms