Protein–RNA interactions for Protein: A2ARI4

Lgr4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr4A2ARI4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lgr4A2ARI4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Lgr4A2ARI4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lgr4A2ARI4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lgr4A2ARI4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lgr4A2ARI4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lgr4A2ARI4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lgr4A2ARI4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lgr4A2ARI4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lgr4A2ARI4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lgr4A2ARI4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lgr4A2ARI4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lgr4A2ARI4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lgr4A2ARI4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lgr4A2ARI4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lgr4A2ARI4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lgr4A2ARI4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lgr4A2ARI4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lgr4A2ARI4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lgr4A2ARI4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lgr4A2ARI4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lgr4A2ARI4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lgr4A2ARI4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lgr4A2ARI4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lgr4A2ARI4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lgr4A2ARI4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lgr4A2ARI4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lgr4A2ARI4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lgr4A2ARI4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lgr4A2ARI4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lgr4A2ARI4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lgr4A2ARI4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lgr4A2ARI4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lgr4A2ARI4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lgr4A2ARI4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lgr4A2ARI4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lgr4A2ARI4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lgr4A2ARI4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lgr4A2ARI4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lgr4A2ARI4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lgr4A2ARI4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lgr4A2ARI4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lgr4A2ARI4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lgr4A2ARI4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lgr4A2ARI4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lgr4A2ARI4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lgr4A2ARI4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lgr4A2ARI4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lgr4A2ARI4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lgr4A2ARI4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lgr4A2ARI4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lgr4A2ARI4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lgr4A2ARI4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lgr4A2ARI4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lgr4A2ARI4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lgr4A2ARI4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lgr4A2ARI4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lgr4A2ARI4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lgr4A2ARI4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lgr4A2ARI4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lgr4A2ARI4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lgr4A2ARI4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lgr4A2ARI4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lgr4A2ARI4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lgr4A2ARI4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lgr4A2ARI4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lgr4A2ARI4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lgr4A2ARI4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lgr4A2ARI4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lgr4A2ARI4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lgr4A2ARI4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lgr4A2ARI4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lgr4A2ARI4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lgr4A2ARI4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lgr4A2ARI4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lgr4A2ARI4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lgr4A2ARI4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgr4A2ARI4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgr4A2ARI4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgr4A2ARI4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgr4A2ARI4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lgr4A2ARI4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lgr4A2ARI4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lgr4A2ARI4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lgr4A2ARI4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lgr4A2ARI4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lgr4A2ARI4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lgr4A2ARI4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lgr4A2ARI4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lgr4A2ARI4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lgr4A2ARI4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lgr4A2ARI4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lgr4A2ARI4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lgr4A2ARI4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lgr4A2ARI4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lgr4A2ARI4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lgr4A2ARI4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lgr4A2ARI4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lgr4A2ARI4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lgr4A2ARI4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms