Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVH6

1520401A03Rik, RIKEN cDNA 1520401A03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1520401A03RikA0A0J9YVH6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1520401A03RikA0A0J9YVH6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1520401A03RikA0A0J9YVH6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
1520401A03RikA0A0J9YVH6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1520401A03RikA0A0J9YVH6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1520401A03RikA0A0J9YVH6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1520401A03RikA0A0J9YVH6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1520401A03RikA0A0J9YVH6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
1520401A03RikA0A0J9YVH6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
1520401A03RikA0A0J9YVH6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms