Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 AC022507.1-201ENST00000548349 1505 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CNTN3Q9P232 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms