Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
LRRIQ1Q96JM4 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LRRIQ1Q96JM4 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
LRRIQ1Q96JM4 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
LRRIQ1Q96JM4 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
LRRIQ1Q96JM4 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
LRRIQ1Q96JM4 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
LRRIQ1Q96JM4 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
LRRIQ1Q96JM4 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
LRRIQ1Q96JM4 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
LRRIQ1Q96JM4 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
LRRIQ1Q96JM4 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
LRRIQ1Q96JM4 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
LRRIQ1Q96JM4 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
LRRIQ1Q96JM4 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
LRRIQ1Q96JM4 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
LRRIQ1Q96JM4 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
LRRIQ1Q96JM4 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
LRRIQ1Q96JM4 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
LRRIQ1Q96JM4 KCNMA1-203ENST00000354353 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC023136.1-201ENST00000513093 1105 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms