Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAM2Q15035 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234.2 ms