Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.9 ms