Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms