Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 SPTY2D1-AS1-206ENST00000636011 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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