Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AC084880.1-201ENST00000392530 545 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 HMGB3P1-201ENST00000393368 573 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AL136968.2-201ENST00000407959 354 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 TMSB10P1-201ENST00000415070 132 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AL353194.1-201ENST00000451507 441 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 NACA2-201ENST00000521764 777 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 IGLV7-35-201ENST00000523314 340 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
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MKRN4PQ13434 AC008392.1-201ENST00000600941 437 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
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MKRN4PQ13434 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
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MKRN4PQ13434 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 TEX46-203ENST00000622840 479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 LINC01620-205ENST00000637248 546 ntTSL 4 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 LINC00184-201ENST00000429269 2270 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 ADAL-202ENST00000422466 3767 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 PSG3-204ENST00000595140 1724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 MTF2-201ENST00000370298 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 FBXO38-202ENST00000340253 4424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 TDRD9-201ENST00000339063 3447 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 SORL1-204ENST00000525532 3836 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 VPS11-206ENST00000614944 3388 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 FAM111A-202ENST00000420244 3780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 ARMCX3-207ENST00000537169 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
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MKRN4PQ13434 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
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MKRN4PQ13434 SRL-201ENST00000399609 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
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MKRN4PQ13434 MORF4L2-201ENST00000360458 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
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MKRN4PQ13434 AP004147.1-201ENST00000505153 6314 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
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MKRN4PQ13434 ZNF143-204ENST00000396604 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 MITF-214ENST00000472437 1995 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 DLG2-229ENST00000531015 2892 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 ETV3-202ENST00000368192 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
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