Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC138512.1-201ENST00000563190 434 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 ZSCAN32-212ENST00000574940 2180 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 HINT1P2-201ENST00000604731 235 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 ZNF334-206ENST00000625284 2495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 SVIL-203ENST00000375400 6729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AP003393.1-201ENST00000532153 4476 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AP000552.1-202ENST00000436681 3714 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AMPH-201ENST00000325590 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 ABRAXAS2-201ENST00000298492 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 SLC6A15-211ENST00000552192 2221 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 IPO11-201ENST00000325324 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 SEMA4D-208ENST00000422704 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 OR3A4P-201ENST00000323164 1624 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 TCP11L2-202ENST00000546625 3198 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 ZNF469-202ENST00000565624 13279 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 TECPR2-203ENST00000558678 4281 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 FAM193A-204ENST00000505311 4110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 DCTN2-202ENST00000543672 1321 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 ARMC2-202ENST00000368972 3663 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 SPARC-201ENST00000231061 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 SERPINB9-201ENST00000380698 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 PARG-201ENST00000402038 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 NAV2-208ENST00000527559 11171 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 SMAD9-203ENST00000399275 5389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 VASH2-206ENST00000366968 4224 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 CEP57-201ENST00000325486 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC078846.1-201ENST00000608694 7083 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 ZNF623-202ENST00000501748 6759 ntAPPRIS P3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 PRKAR1A-211ENST00000586397 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 HAUS6-201ENST00000380496 3756 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 GJB2-202ENST00000382848 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 THAP12P7-201ENST00000520248 2290 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 PHBP1-201ENST00000392260 808 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC007000.1-201ENST00000453064 794 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 RN7SL320P-201ENST00000484133 295 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 RACK1-211ENST00000504726 388 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC110768.2-201ENST00000506540 329 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC067930.1-201ENST00000517300 291 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AL590560.1-203ENST00000544342 408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 TTLL7-201ENST00000260505 7976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 MAX-202ENST00000284165 3155 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 ANAPC16-201ENST00000299381 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC104574.2-201ENST00000559783 1985 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 GRAMD1B-206ENST00000529432 6266 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AL356289.3-201ENST00000640049 2669 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 CD22-204ENST00000536635 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 FAM13C-214ENST00000611933 3033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 MEGF10-201ENST00000274473 7594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 MERTK-203ENST00000421804 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 PPIP5K1-207ENST00000396923 5636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 HACL1-208ENST00000456194 1880 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 MLH1-201ENST00000231790 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 ANPEP-201ENST00000300060 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 IFT122-205ENST00000431818 4414 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 CYP4A22-201ENST00000294337 1725 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC025822.2-201ENST00000455199 2287 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 SEMA6D-203ENST00000355997 5908 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 ATP5G3-201ENST00000284727 5484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 ACP6-205ENST00000583509 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 C8orf44-201ENST00000390159 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 PARP9-201ENST00000360356 3198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 FAM181A-AS1-202ENST00000554742 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 RAE1-202ENST00000395840 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 CLASP1-201ENST00000263710 8092 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 COL4A6-208ENST00000538570 6528 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 RCBTB2-201ENST00000344532 3232 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 PCOTH-201ENST00000382133 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms