Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRGP23470 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPRGP23470 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPRGP23470 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPRGP23470 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPRGP23470 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPRGP23470 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRGP23470 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRGP23470 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRGP23470 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRGP23470 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRGP23470 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRGP23470 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRGP23470 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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