Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 OR52I1-202ENST00000530443 2961 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 LINC01128-205ENST00000445118 6606 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 PRND-201ENST00000305817 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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