Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 ACYP1-204ENST00000555135 639 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 HNRNPA1P74-201ENST00000560782 835 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 MIR7515HG-250ENST00000592565 856 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 ZEB2-AS1-206ENST00000602006 572 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 LINC01396-201ENST00000609099 527 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC004839.1-201ENST00000610269 501 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 PAGE4-201ENST00000218068 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 FTH1P26-201ENST00000406512 701 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 PPIAP23-201ENST00000420099 497 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC104076.1-201ENST00000428080 265 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC019185.3-201ENST00000438805 323 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms