Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-1B6SEH8 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms