Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 BOLA2P1-201ENST00000584794 232 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 uc_338.37-201ENST00000620113 186 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 CCNT1-206ENST00000640148 596 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 SNORA51.7-201ENST00000384171 134 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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PHACTR1Q9C0D0 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 HIST1H2APS6-201ENST00000448609 364 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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PHACTR1Q9C0D0 AC009411.2-201ENST00000458359 539 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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PHACTR1Q9C0D0 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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PHACTR1Q9C0D0 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PHACTR1Q9C0D0 AC125232.1-201ENST00000452554 1408 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PHACTR1Q9C0D0 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PHACTR1Q9C0D0 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PHACTR1Q9C0D0 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PHACTR1Q9C0D0 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PHACTR1Q9C0D0 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PHACTR1Q9C0D0 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
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