Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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CCDC142Q17RM4 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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CCDC142Q17RM4 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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CCDC142Q17RM4 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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CCDC142Q17RM4 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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CCDC142Q17RM4 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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