Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NRF1Q16656 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.3 ms