Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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