Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms