Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms