Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms