Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RN7SKP207-201ENST00000411204 303 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 EEF1GP7-201ENST00000422983 703 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 LINC01829-202ENST00000433133 2100 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC114488.2-222ENST00000445166 362 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC108688.1-201ENST00000485817 713 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RNA5SP518-201ENST00000515957 119 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 SCARNA20.1-201ENST00000516009 138 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 ASB8-207ENST00000536953 923 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 TIMM9-205ENST00000555404 430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 NDUFA3P4-201ENST00000560814 250 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CYP4A44P-201ENST00000569984 154 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC097467.3-210ENST00000597939 705 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC133041.1-201ENST00000608389 201 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC022743.1-201ENST00000624990 664 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 GRAMD2B-212ENST00000513040 2196 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
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CLN3Q13286 ART4-201ENST00000228936 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 NKRF-201ENST00000304449 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
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CLN3Q13286 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 ALPK1-201ENST00000177648 4537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
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CLN3Q13286 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC123904.1-201ENST00000441072 368 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC005550.2-201ENST00000476382 318 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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CLN3Q13286 FXYD2-206ENST00000532119 562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AL358334.3-201ENST00000557343 535 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 IGHV1OR15-3-201ENST00000564926 351 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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