Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 HNRNPA3-202ENST00000411529 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 GPD2-202ENST00000409125 2661 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 TDP1-201ENST00000335725 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 CPSF1P1-201ENST00000397477 3730 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 PPP6R3-201ENST00000265636 4794 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 LPIN3-205ENST00000632009 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 CEP41-217ENST00000541543 6222 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 ENTPD3-201ENST00000301825 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 L3MBTL3-204ENST00000526019 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 HPSE-202ENST00000405413 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 SPATA31E2P-201ENST00000554414 4965 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 DTNA-233ENST00000601125 1931 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 NSD2-212ENST00000503128 8568 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 EPB41L2-224ENST00000530481 3914 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 RALGDS-204ENST00000393157 3689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 Z98751.1-201ENST00000413827 381 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 PDCL3P3-201ENST00000417487 715 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 RN7SL107P-201ENST00000478127 283 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AC002070.1-201ENST00000537366 693 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AP003174.3-201ENST00000537926 516 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AC010760.1-201ENST00000565129 545 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 FXYD5-210ENST00000588699 927 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 APOC1-202ENST00000588750 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 ZNF431-203ENST00000594425 610 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AC108451.2-201ENST00000603875 538 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.61-201ENST00000613464 315 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AC073488.2-201ENST00000631903 751 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AC073488.7-201ENST00000633785 778 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 EPB41-203ENST00000349460 3029 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 LIMCH1-203ENST00000396595 5740 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 PRAMEF4-201ENST00000235349 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 NHS-204ENST00000615422 8860 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 TEX2-201ENST00000258991 5232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 CACNA1S-201ENST00000362061 6166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AMPD1-201ENST00000369538 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 RND3-203ENST00000409557 2372 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 VPS8-204ENST00000424463 2359 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 GPR50-201ENST00000218316 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 PTPRA-202ENST00000318266 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 OSBPL3-203ENST00000396431 2969 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 TUFT1-203ENST00000368849 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 TRIM59-201ENST00000309784 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 ZSCAN20-201ENST00000361328 4316 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 PRKCH-211ENST00000555082 2932 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 RTL10-203ENST00000407472 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 TNKS-201ENST00000310430 9620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 PBLD-204ENST00000358769 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AASS-203ENST00000417368 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 NAV1-202ENST00000367296 13091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 MRPL19-202ENST00000393909 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 IGLV8-61-201ENST00000390283 414 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 TRBV5-1-201ENST00000390381 652 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 RN7SKP54-201ENST00000410704 269 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC092100.1-203ENST00000421513 653 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 GAPDHP68-201ENST00000434621 1008 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AL163953.1-201ENST00000436530 726 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 TRBV22OR9-2-201ENST00000441373 136 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 ENTPD3-AS1-204ENST00000452768 724 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 RN7SL554P-201ENST00000468197 292 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 RN7SL318P-201ENST00000471955 297 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC113367.1-201ENST00000498453 532 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 GAPDHP38-201ENST00000503632 1002 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 GJA1P1-201ENST00000511478 1143 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 TSHR-203ENST00000541158 4566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC023509.1-201ENST00000547717 1571 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 AC055736.1-201ENST00000548135 629 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HOXD11P31277 STAT2-210ENST00000557235 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
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