Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 NDUFB3-202ENST00000433898 503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 FXYD6P1-201ENST00000604857 285 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 DTNA-221ENST00000591182 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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