Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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RTL8BQ17RB0 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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RTL8BQ17RB0 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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RTL8BQ17RB0 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
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