Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 ZNF555-201ENST00000334241 8557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 ATF7-202ENST00000456903 5218 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 ATG2B-202ENST00000359933 13684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 ADGRF5-202ENST00000283296 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 KIF6-202ENST00000287152 9082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 ZNF397-202ENST00000330501 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 MUC3A-201ENST00000379458 11226 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 OR2F1-203ENST00000641412 4829 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 MAP3K9-207ENST00000611979 10497 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 LPP-208ENST00000448637 5835 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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LAMA3Q16787 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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LAMA3Q16787 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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LAMA3Q16787 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 XIAP-202ENST00000371199 8591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 NHSL2-207ENST00000633930 13660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 PTPRT-205ENST00000373193 12681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAMA3Q16787 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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