Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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