Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 GON4L-201ENST00000271883 7138 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 PDE4B-206ENST00000423207 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CDY1-202ENST00000361963 2177 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC013562.1-201ENST00000519427 1722 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CCR8-201ENST00000326306 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 THEM5-201ENST00000368817 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 SS18L2P1-201ENST00000445923 213 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL356364.1-201ENST00000458443 182 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 IGKV2-29-201ENST00000521304 372 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC079362.1-202ENST00000547089 278 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 LINC02019-202ENST00000609204 845 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CR392039.3-201ENST00000623236 227 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 OR7E161P-202ENST00000641994 1033 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC009318.1-201ENST00000553105 2380 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 PIWIL2-204ENST00000521356 3488 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 ZFP62-207ENST00000512132 4010 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL162171.3-201ENST00000617439 3178 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 OR4F15-201ENST00000332238 2119 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 DCP1B-205ENST00000540622 1547 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 KPNA1-201ENST00000344337 6830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC139491.2-201ENST00000515403 3632 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CNTN4-201ENST00000397459 2322 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AP2B1-221ENST00000621914 5702 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 PRKCQ-204ENST00000610727 3077 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AGR2-203ENST00000419304 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AGBL1-205ENST00000635782 3201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 SLC25A24-202ENST00000370041 3404 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CTD-2201I18.1-202ENST00000514042 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 ADA2-203ENST00000399837 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 SNORA70.8-201ENST00000384231 136 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
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