Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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PTP4A2Q12974 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
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PTP4A2Q12974 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
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PTP4A2Q12974 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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