Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
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FOXD4Q12950 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
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FOXD4Q12950 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
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FOXD4Q12950 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
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FOXD4Q12950 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
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FOXD4Q12950 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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